一、补偿标准（一）报销比例
1、普通门诊补偿：门诊补偿只限于市内定点医疗机构，其他医疗机构就诊的不予补偿。门诊补偿不设起付线，实行单日单次处方限额直接补偿，医药费用补偿比例为30%。
2、常规住院补偿：按就诊机构级别设置起付线和报销比例。乡镇卫生院起付线100元，报销比例80%；市级综合医疗机构设起付线500元，报销比例60%；市级专科医疗机构设起付线300元，报销比例60%；本市外定点医疗机构设起付线1000元，报销比例40%。对民政等部门登记在册的低保户、在乡重点优抚对象和革命“五老”人员、重度残疾人等群体不设起付线。年内参合人员因患疾病多次住院的，分次计算起付线。
3、特殊病种大额门诊费用补偿：参加合作医疗者患（1）高血压；（2）糖尿病；（3）甲亢；（4）慢性肾炎及尿毒症透析；（5）恶性肿瘤门诊治疗；（6）脑血管意外；（7）系统性红斑狼疮；（8）冠心病；（9）再生障碍性贫血；（10）精神病等10个病种，经市合医办批准，可以在指定的定点医院门诊治疗，医药费用补偿不设起付线，报销比例40%。
基金补偿计算公式：报销金额=[总医药费用-自费项目费用-起付线]×补偿比例
（二）补偿封顶线：
1、参合农民年度发生的门诊医疗费补偿封顶线为每人每年30元。
2、参合农民年度发生的住院医疗费补偿封顶线为：累计补偿每人每年40000元。
3、特殊病种大额门诊费用补偿封顶线为：累计补偿每人每年6000元。