申请回避的程序为:1、当事人向法院提出回避申请的,应在案件开始审理时提出,最晚可以在法庭辩论终结前提出,如果超出了这个时间,当事人没有提出申请的,申请回避的权利即丧失;2、法院收到回避申请后,会对回避理由进行审查,并作出是否回避的决定;3、当事人提出回避申请时,应当说明事实和理由,并提交相应证据予以证明。

法律依据

《中华人民共和国民事诉讼法》第四十六条的规定:当事人提出回避申请,应当说明理由,在案件开始审理时提出;回避事由在案件开始审理后知道的,也可以在法庭辩论终结前提出。