出版合同丢了应该利用复印件或者是扫描件来处理。双方当事人都承认出版合同确实存在,并且已经按照合同当中的内容来履行自身义务了,也不会存在太大的影响,如果对方不承认的,应当搜集证据证明合同确实存在。