传染毒种扩散罪的处罚标准是:行为人实施该犯罪行为,后果严重的,处三年以下有期徒刑或者拘役;导致后果特别严重的,会判处三年以上七年以下有期徒刑。

法律依据

《中华人民共和国刑法》第三百三十一条 传染病菌种、毒种扩散罪从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员,违反国务院卫生行政部门的有关规定,造成传染病菌种、毒种扩散,后果严重的,处三年以下有期徒刑或者拘役;后果特别严重的,处三年以上七年以下有期徒刑。