我国的民事诉讼法规定,一般情况下,起诉方可以通过以下证据来证明夫妻双方已经分居两年:1、分居一方在外居住的房屋租赁合同;2、夫妻分居的书面协议。如果是口头协议的,那么要获得另一方的承认;3、双方沟通的书信、电子邮件等可以证明双方感情不和、分居的事实;4、人证,或者证人证言。

法律依据

《中华人民共和国民事诉讼法》 第六十三条规定,证据包括:(一)当事人的陈述;(二)书证;(三)物证;(四)视听资料; (五)电子数据;(六)证人证言;(七)鉴定意见;(八)勘验笔录。证据必须查证属实,才能作为认定事实的根据。