1、福利不同。

底薪不包括加班加点工资，中班、夜班、高温、低温、井下、有毒有害等特殊工作环境、条件下的津贴，以及国家法律法规、政策规定的劳动者保险、福利待遇和企业通过贴补伙食、住房等支付给劳动者的非货币性收入等。

保底工资是企业员工同一职位，可以根据其能力进行工资分不同等级。基本工资是根据劳动合同约定或国家及企业规章制度规定的工资标准计算的工资。也称标准工资。在一般情况下，基本工资是职工劳动报酬的主要部分。

2、国家规定不同。

保底工资是政府定的，是劳动者提供正常劳动后用人单位最低应该提供的数额。而底薪是单位内部的工资结构的问题。

3、付出程度不同。

底薪可以根据其能力进行工资分不同等级按不同程度来发放。保底工资是工人在工厂工作时，一般采用工作底薪加奖励。

实行保底工资注意事项：

1、保底工资不等于固定工资；

2、保底工资一般包括基本工资、岗位工资、绩效工资或计件工资，但一般不包括工龄工资、高温补贴等其他补贴；

3、如工人长时间有事假导致无法完成固定任务时，可以取消当月保底工资。

4、理论上来说，请长期病假、年假、婚假、产假等带薪假，都可以取消保底工资，因为保底工资并非固定工资，带薪假可以按照基本工资发放，但一般都会取消保底工资和全勤奖。