一、法院是否应明示可以申请笔迹鉴定?

人民法院审理案件，查清案件的事实，是案件裁判的基础。诉讼双方当事人在笔迹上面存在争议，法院应该在庭审的时候指明，建议当事人去做笔迹鉴定。被告对该欠条上的署名不予认可的情况下，原告的举证责任是否已经完成的问题。如果认为原告的举证责任已经完成，那么举证责任即应转移至被告，被告应申请笔迹鉴定，被告不申请鉴定，应负举证不能的法津责任，并承担败诉的风险。如果认为原告的举证责任尚未完成，那么原告应申请笔迹鉴定，原告不申请鉴定，同样应负举证不能之责，并承担败诉的风险。

二、司法鉴定的程序是怎样的?

1、司法鉴定机关接受委托与受理

(2)司法鉴定机构应当统一受理办案机关的司法鉴定委托。

(3)委托人委托鉴定的，应当向司法鉴定机构提供真实、完整、充分的鉴定材料，并对鉴定材料的真实性、合法性负责。司法鉴定机构应当核对并记录鉴定材料的名称、种类、数量、性状、保存状况、收到时间等。

(3)诉讼当事人对鉴定材料有异议的，应当向委托人提出。

2、司法鉴定的实施

(1)司法鉴定机构受理鉴定委托后，应当指定本机构具有该鉴定事项执业资格的司法鉴定人进行鉴定。

(2)委托人有特殊要求的，经双方协商一致，也可以从本机构中选择符合条件的司法鉴定人进行鉴定。

(3)委托人不得要求或者暗示司法鉴定机构、司法鉴定人按其意图或者特定目的提供鉴定意见。

(4)司法鉴定机构对同一鉴定事项，应当指定或者选择二名司法鉴定人进行鉴定;对复杂、疑难或者特殊鉴定事项，可以指定或者选择多名司法鉴定人进行鉴定。

3、司法鉴定意见书的出具

(1)司法鉴定机构和司法鉴定人应当按照统一规定的文本格式制作司法鉴定意见书。

(2)司法鉴定意见书应当由司法鉴定人签名。多人参加的鉴定，对鉴定意见有不同意见的，应当注明。

(3)司法鉴定意见书应当加盖司法鉴定机构的司法鉴定专用章。

综上所述，在合同纠纷案件中，经常会有当事人对签字有争议的，法院审理阶段，为了保障公平，明确证据，法院应当提出做笔迹鉴定，当事人可以自行申请，也可以通过法院委托。笔迹鉴定结果出具后，如果对其有异议，还能申请重新鉴定。