商铺租赁合同纠纷的问题：

一、租赁房屋的权属问题

1、承租前核实权属。承租方在签订商业地产租赁协议前需要核实房屋产权证书的原件，必要时还应在房屋交易中心查询房屋权属登记情况。

2、关于租赁房屋设立抵押的问题。《物权法》第一百九十条规定：“订立抵押协议前抵押财产已出租的，原租赁关系不受该抵押权的影响。抵押权设立后抵押财产出租的，该租赁关系不得对抗已登记的抵押权。”

二、租赁协议期间的装修问题

1、关于装修范围必须书面征得出租人的同意。承租人在装修前，应将房屋装修设计方案取得出租人认可;明确承租人违反上述约定应承担的恢复原状、赔偿损失、支付违约金等责任。

2、不能损害原房屋主体结构，影响房屋建筑安全。为防止因承租人装修造成房屋结构破坏，出租人可以要求承租人预先支付一定数额的钱款作为装修保证金，以保证承租人履行其装修条款中约定的义务。

3、协议期满或提前终止时，装修折旧与补偿方式一定要约定清楚。

三、承租人的优先承担权

大多数承租人希望能享受该商铺的优先承租权，但是全国性法律并没有明确规定承租人的优先承租权，面对如何要保障自己的优先承租权，建议承租人可以协议中约定。

四、租赁协议解除问题

租赁协议的解除也涉及到多方原因，将其分别在协议中加以明确可以更好地保护当事人的权利。