1、户籍管辖和管理机构不同。地区行政辖区户籍归户籍所在地的地方政府机关直接管辖和管理的,一切问题的解释权归地方政府机关;兵团行政辖区户籍归兵团行政区来直接安排负责管辖和管理,一切问题的解释权归兵团行政区。

2、地域划分不同。兵团行政辖区户籍集中在新疆维吾尔自治区,归属于新疆生产建设兵团地区区域;地区行政辖区户籍是除新疆维吾尔自治区以外的其他行政地区区域。

3、生产活动的安排负责机关不同。地区行政辖区户籍的教育,医疗,司法等活动都是地方政府机关安排负责的。兵团行政辖区户籍的教育,医疗,司法等是由兵团行政区来安排负责的。

4、户口的类别不同。兵团户口是集体户口,地区户口是家庭户口。集体户口领取的是户口卡,而家庭户口领取的是户口簿,当然,户口簿和户口卡的作用是一样的,他们都是正式户口,都要经过人事局、计生局和公安局盖章批准办理。