当员工面临公司克扣自己工资时,首先应该就此问题跟公司协商解决,避免走到最后诉讼仲裁的地步,若是协商不成则员工可以向当地劳动调解部门申请介入调解,需要注意的是此调解并不具备法律的强制性,因此若公司依然拒绝配合,则员工需要向相关劳动仲裁机构申请仲裁,在经过诉讼仲裁的程序之后还可以继续向人民法院起诉。

法律依据

《中华人民共和国劳动法》第七十七条,劳动争议发生后,当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解;调解不成,当事人一方要求仲裁的,可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的,可以向人民法院提起诉讼。