这几年来我们国家正在前进之中，国内很多的地方也在国家稳定发展的大环境下，努力的发展和建设着，为了能够更好的迎合时代发展的潮流，许多地方的人民政府选择了参考当地实际状况然后制定合适的政策和计划来推动当地实施和开展一些房屋拆迁和土地征收等建设工程，但是在这些工程实施的同时，也是激发出了不少的问题和纠纷，其中，有一部分的二层商用房也在拆迁的范围内，那么对于这种房屋拆迁的时候应该怎么补偿呢？

根据我们国家现行的法律法规中，对于二层商用房拆迁这个方面的条例来看，可以知道的是，对于这种类型的房屋实施拆迁工程的时候，具体的补偿是需要根据被拆迁房屋的实际情况才能得知的。如果房屋和土地分开补偿，土地就依照商业用途进行补偿，而房屋及其附属物按重置成新价补偿。但是如果是房地合一补偿，那么就依照商业房地产市场价值(评估确定)进行补偿，需要注意的是，这两种方式都是会给予被拆迁人一定的搬迁补助和停产停业损失。

在现实生活中，也是出现过，拆迁方给予被拆迁人补偿标准不够合理的情况的，被拆迁人需要知道的是，在自家合法的二层商用房在拆迁的时候如果得到了不合理的补偿标准，首先要做的就是拒绝签署相关的拆迁协议，然后及时的和拆迁方进行沟通，或者告知当地政府的相关部门，也可以直接起诉拆迁方，但是千万不要坐以待毙。

综上所述，可以知道的是，在二层商业房拆迁的时候，对于土地和房屋分开与否，补偿标准都是不同的，需要根据实际的拆迁情况才能做出相应的分析和判断。被拆迁人若是对于这个问题仍有疑虑，可以联系专业的拆迁律师，尽快的解答。