一、补充侦察两次证据不足怎么办?

补充侦察两次证据不足的情况下，公安机关应该撤销案件，解除羁押。补充侦查以二次为限，二次补充侦查后，仍证据不足不符合起诉条件的，检察院可以决定不起诉，公安机关应该撤销案件，解除羁押。人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料。补充侦查有两种情况，即审查起诉阶段的补充侦查和法庭审理阶段的补充侦查。

(一)审查起诉阶段的补充侦查的形式、次数：人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在1个月以内补充侦查完毕。补充侦查以2次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。经过两次补充侦查，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。审查起诉阶段的补充侦查，由人民检察院决定。对于公安机关侦查终结，需要补充侦查时，既可以决定将案件退回公安机关补充侦查，也可以决定自行侦查，必要时可以要求公安机关协助。

(二)法庭审理阶段的补充侦查的形式和次数：在法庭审理过程中，检察人员发现提起公诉的案件需要补充侦查，并提出建议的，人民法院可以延期审理。但是该建议以2次为限。人民检察院应当在1个月内补充侦查完毕。合议庭在案件的审理过程中，发现被告人可能有自首、立功等法定量刑情节，而起诉和移送的证据材料没有这方面的证据材料，应当建议人民检察院补充侦查。

二、法律依据

根据《刑事诉讼法》第一百四十条规定：

人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料。

人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。

根据法律的规定，补充侦察两次后就不能再进行侦察了，这种情况下公安机关应当根据相关法律的规定，释放当事人。在司法实践中，这种情况是很少见的，可以是一开始的时候侦察方向出现了偏差，或者证据认定时失败导致司法机关的认定出现了错误，具体情况应当根据实际来进行认定。