工资到5000元的时候要扣除个税。基本工资超过5000元,要交个人所得税,应纳个人所得税税额等于应纳税所得额乘适用税率减速算扣除数。应纳税所得额等于扣除三险一金后月收入减扣除标准。

【法律依据】

根据《个人所得税法》第十一条,居民个人取得综合所得,按年计算个人所得税;有扣缴义务人的,由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款。