购房土地使用证的办理程序是:

1.土地登记申请人应持有关土地权属来源证明相关材料,向国土资源局提出申请;

2.对土地登记申请人的土地采取实地调查、核实等;

3.土地登记机关对土地使用者提交的土地登记申请书等进行审核;

4.颁发国有土地使用权证书。

【法律依据】

根据《土地管理法实施条例》第三条,国家依法实行土地登记发证制度。

依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护,任何单位和个人不得侵犯。