在适用本罪时,要注意区分伪造.变造.转让金融机构经营许可证罪和伪造.变造.买卖国家机关文件.证件.印章罪和盗窃.抢夺.毁灭国家机关公文.证件.印章罪。1.犯罪对象并不完全一样。前一种是针对金融机构经营许可的,后一种是针对文件.文件和印章。银行经营执照当然也是一种证件,因此,二者在犯罪对象上有交叉。2.不同的行为方式是不同的。前一种是伪造的,变造的,另一种是转让,另一种是伪造的.变造的,另一种是盗窃.抢劫,毁灭。实际上,如系伪造.变造.转让金融机构经营许可证,尽管该金融机构经营许可证也属一种证件,但由于法