由于事业单位具有分布较广、类型复杂等特点，在转制、改制过程中不能就改制单位的形态进行“一刀切”，而是要根据各个单位的不同特点来决定其改制的形式;从改制单位的股权设置角度来说，也不能片面强调国有资本全部退出，而要根据各单位的不同情况，在鼓励经营者持大股的前提下，有选择的保留部分国有股份。根据大多数事业单位的实际情况，按照现代企业制度的要求，改制为有限责任公司是一种常见的做法。有限责任公司具有注册资本要求较低、设立程序简单、出资方式灵活、治理结构设置灵活、改制成本低等特点，比较适合于那些参股人数较少、企业资产不是很多的企业。改制成有限责任公司可以从产权制度改革上一步到位，有利于企业的经营层、主要经营者和业务骨干持大股。股份合作制企业是我国由计划经济向市场经济转轨过程中发展出来的、独具中国特色的企业组织形式。这种组织形式在历史上具有积极的意义，但总的来说，仍然是向现代企业制度过渡的一种中间形态。随着社会主义市场经济的发展和企业规模的壮大，目前许多股份合作制企业正走向规范的股份制。因此，我们认为，除了对那些职工入股愿望强烈、人数较多的单位外，一般不宜再采用这类组织形式。对于那些资产规模大、经济效益好的单位，股份有限公司则是最佳的选择。在设立股份有限公司时，我们认为有必要保留部分国有股份，同时也应积极吸收社会上的各种投资基金的介入。这样，既能有效地保证国有资产的保值和增值，也能更深地加强企业同资本市场的联系，使企业具有更强的生命力。