有以下几种处理方式:1、变更公司组织形式,由有限公司,变更为股份有限公司。股份有限公司的股东为2-200人。2、一些股东的股权由其他股东代持,在工商登记中不超过50个股东,但是对被代持的股东可能会存在一定风险。3、设立一个持股平台,比如有限合伙企业或者有限公司,将有些股东的股权通过这个平台间接持有。