一旦有以暴力、威胁方法，阻碍指挥人员或者值班、值勤人员执行职务的行为，就会立案。阻碍执行军事职务罪的认定(一)区分本罪与非罪的界限判定一种阻碍执行职务的行为是否构成犯罪，从以下几个方面判断：1、行为人主观上有无故意阻挠军队指挥、值班、值勤人员执行职务的目的。如果属于对指挥、值班、值勤人员发牢骚、讲怪话、态度生硬，或者仅有一般嘲讽、辱骂，甚至轻微的顶撞行为，行为人并不希望对方停止、变更、放弃执行职务结果发生的，不应以犯罪论处。2、客观上行为人是否实施了暴力、威胁手段，是否因此发生了指挥、值班、值勤人员停止、放弃、变更执行职务或无法执行职务的后果。如果行为人虽然实施了某种阻挠行为，但只是影响了指挥、值班、值勤人员正常执行职务，或者对方虽然出现了停止、放弃、变更执行职务或者无法执行职务的结果，但与行为人的行为并无必然的因果关系，也不应以犯罪论处。3、行为人的阻碍行为对国家军事利益侵害的轻重程度。如果行为人阻碍指挥、值班、值勤人员执行职务的情节、后果、危害均不严重，就应按军纪处理。反之，如果因行为人的阻碍行为，致使国家的军事利益遭受损害的，表明其行为的情节、后果、危害达到应追究刑事责任的程度，就应以犯罪论处。(二)区分本罪与阻碍军人执行职务罪的界限1、阻碍执行军事职务罪侵害的是指挥和值班、值勤秩序，而阻碍军人执行职务罪侵害的是军人依法执行职务的秩序。2、阻碍执行军事职务罪的犯罪对象限定为指挥人员或者值班、值勤人员，而阻碍军人执行职务罪的犯罪对象是所有军人，其中包括了指挥人员或者值班、值勤人员。3、阻碍执行军事职务罪的犯罪主体是所有军人，而阻碍军人执行职务罪的犯罪主体是所有达到刑事责任年龄、具有刑事责任能力的公民，包括了所有军人。因此，当军人阻碍其他军人依法执行职务时，如果被阻碍执行职务的是指挥人员或者值班、值勤人员，则应以阻碍执行军事职务罪论处;如果被阻碍执行职责的是其他军人，则应以阻碍军人执行职务罪论处。(三)犯本罪致人重伤、死亡的定罪量刑本罪致人重伤、死亡的定罪，在行为人以故意伤害他人的暴力方法阻碍指挥人员或者值班、值勤人员执行职务时，可能会造成被害人重伤或者死亡的后果。在这种情况下，行为人虽然对造成他人伤害的结果主观上也是故意实施的，客观上也实施了故意伤害的行为，但这种伤害行为已与阻碍执行职务的行为发生犯罪竞合关系。鉴于本法对阻碍执行军事职务罪有特别规定，其中对致人重伤或者死亡的法定刑重于本法第234条故意伤害罪致人重伤、死亡的法定刑，而且本法第234条还明确规定“本法另有规定的，依照规定”，所以应一律以阻碍执行军事职务罪论处，不能再定故意伤害罪。通过上述介绍可知，阻碍执行军事职务罪指以暴力、威胁方法，阻碍指挥人员或者值班、值勤人员执行职务的行为。