公司股权转让，应当由转让人，按照百分之二十的比例税率来缴纳个人所得税。个人的应纳税额是，转让股权的收入总额减去股权的原值和合理费用后的剩余金额。

法律依据

《中华人民共和国个人所得税法》第二条下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：（六）利息、股息、红利所得；（七）财产租赁所得；（八）财产转让所得；（九）偶然所得。第三条个人所得税的税率：（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。第六条应纳税所得额的计算：（五）财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额。（六）利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次收入额为应纳税所得额。