工程索赔处理的主要原则是：（一）合法原则。以合同为依据，处理索赔必须做到有理有据；（二）合理原则。分清责任，严格审核费用，加强主动控制，减少工程索赔；（三）时效原则。处理索赔事件时进行时效检查，调解、仲裁、诉讼不得违背时限方面的要求；（四）协商处理原则。先行调解，调解不成时行使裁决或判决。

法律依据

《民事诉讼法》第一百二十二条当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。《民法典》第八百零一条 因施工人的原因致使建设工程质量不符合约定的，发包人有权请求施工人在合理期限内无偿修理或者返工、改建。经过修理或者返工、改建后，造成逾期交付的，施工人应当承担违约责任。