驾驶员在执行职务时肇事的,应当由肇事者承担赔偿责任,因为肇事属于违反道路交通安全法的行为,所以应当由肇事者承担,但肇事者暂时无力赔偿时,此时应由驾驶员所在单位,或机动车的所有人负责垫付。

法律依据

《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的,由用人单位承担侵权责任。用人单位承担侵权责任后,可以向有故意或者重大过失的工作人员追偿。劳务派遣期间,被派遣的工作人员因执行工作任务造成他人损害的,由接受劳务派遣的用工单位承担侵权责任;劳务派遣单位有过错的,承担相应的责任。